Punktmutationen im β-Globingendruck

 

 

 

β-Thalassämie auslösende Mutationen im β-Globingen

 


 

Siehe auch: Deletionen im β-Globingen-Cluster

 


 

Mutation

β0+

Ethnie

 


 

1. Promotor-Mutationen

 


 

ATA-Box

 


 

-28 (A=>G)

+

Chinesen

 

-28 (A=>C)

+

Kurden

 

-29 (A=>G)

+

Afroamerikaner, Chinesen

 

-30 (T=>C)

+

Chinesen

 

-30 (T=>A)

+

Östliches Mittelmeer

 

-31 (A=>G)

+

Japaner

 

-31 (A=>C)

+

Italiener

 

-32 (C=>A)

+

Taiwanesen

 

 

 

CACCC Box

 


 

-86 (C=>G)

+

Libanesen, Thailänder

 

-86 (C=>A)

+

Italiener

 

-87 (C=>G)

+

Mittelmeerraum

 

-87 (C=>T)

+

Deutsche, Italiener

 

-87 (C=>A)

+

Jugoslawen,

 

-88 (C=>A)

+

Kurden

 

-88 (C=>T)

+

Afroamerikaner, Inder

 

-90 (C=>T)

+

Portugiesen, Ashkenazi-Juden

 

-92 (C=>T)

+

Italiener

 

-101 (C=>T)

+

Italiener, östliches Mittelmeer

 

 

 

2. Cap Site-Mutationen

 


 

+1 (A=>C)

+

 

 

 

 

3. Startkodon-Mutationen

 


 

ATG=>AGG

0

Koreaner, Chinesen, Nordeuropäer

 

ATG=>ACG

0

Jugoslawen, Schweizer

 

ATG=>GTG

0

Japaner

 

ATG=>ATT

0

Iraner

 

ATG=>ATA

0

Italiener, Schweden

 

ATG=>ATC

0

Japaner

 

 

 

4. Polyadenylierungs- Mutationen

 


 

AATAAA=>AACAAA

+

Afroamerikaner

 

AATAAA=>AATAAG

+

Kurden

 

AATAAA=>AATAGA

+

Malaysier

 

AATAAA=>AATGAA

+

Mittelmeerraum

 

AATAAA=>A(-AATAA)

+

Araber

 

AATAAA=>AAAA(-AT)

+

Franzosen

 

 

 

5. Spleiß-Mutationen
5.1. Spleißstelle

 


 

IVS-1 Position 1 (G=>A)

0

Mittelmeerraum

 

IVS-1 Position 1 (G=>T)

0

Inder, Chinesen

 

IVS-2 Position 2 (T=>G)

0

Tunesier

 

IVS-1 Position 2 (T=>C)

0

Afroamerikaner, Algerier

 

IVS-1 Position 2 (T=>A)

0

Algerier

 

IVS-1 5'-Ende (-44 bp)

0

Mittelmeerraum

 

IVS-1 Position 130 (G=>A)

0

Ägypter

 

IVS-1 Position 130 (G=>C)

0

Italiener, Türken, Japaner

 

IVS-1 3'-Ende (-17 bp)

0

Kuwait

 

IVS-1 3'-Ende (-25 bp)

0

Inder

 

IVS-2 Position 1 (G=>A)

0

Mittelmeerraum, Tunesier, Afroamerikaner, Japaner

 

IVS-2 Position 1 (G=>C)

0

Iraner

 

IVS-2 Position 2,3
(-TG und Insertion von 11 bp)

0

Iraner

 

IVS-2 Position 849 (A=>G)

0

Afroamerikaner

 

IVS-2 Position 849 (A=>C)

0

Afroamerikaner

 

IVS-2 Position 850 (G=>C)

0

Jugoslawen

 

IVS-2 Position 850 (-G)

0

Italiener

 

IVS-2 Position 850 (G=>A)

0

Nordeuropäer

 

IVS-2 Position 850 (G=>T)

0

Japaner

 

 

 

5. 2. Consensus-Sequenz

 


 

IVS-1 Position -3 (C=>T)
(Codon 29)

+

Libanesen

 

IVS-1 Position -2 (A=>G)
(Codon 30)

0

Sephardische Juden

 

IVS-1 Position -1 (G=>C)
(Codon 30)
(Hb Kairoran oder Monroe)

+

Tunesier, Afroamerikaner

 

IVS-1 Position -1 (G=>A)
(Codon 30)

0

Bulgaren

 

IVS-1 Position 5 (G=>C)

+

Inder,Chinesen, Melanesier

 

IVS-1 Position 5 (G=>T)

+

Mittelmeerraum, Afroamerikaner

 

IVS-1 Position 5 (G=>A)

+

Griechen, *Algerier

 

IVS-1 Position 6 (T=>C)

+

Mittelmeerraum

 

IVS-1 Position 128 (T=>G)

+

Saudi-Araber, Chinesen

 

IVS-2 Position 4,5 (-AG)

0

Portugiesen

 

IVS-2 Position 5 (G=>C)

+

Chinesen

 

IVS-2 Position 837 (T=>G)

+

Inder

 

IVS-2 Position 843 (T=>G)

+

Algerier

 

IVS-2 Position 844 (C=>G)

+

Italiener

 

IVS-2 Position 848 (C=>A)

+

Mittelmeerraum, Iraner, Ägypter, Afroamerikaner

 

IVS-2 Position 848 (C=>G)

+

Japaner

 

 

 

5.3. Alternative Spleißstellen (Intron)

 


 

IVS-1 Position 110 (G=>A)

+

Mittelmeerraum

 

IVS-1 Position 116 (T=>G)

0

Mittelmeerraum

 

IVS-2 Position 654 (C=>T)

+

Chinesen

 

IVS-2 Position 705 (T=>G)

0

Mittelmeerraum

 

IVS-2 Position 745 (C=>G)

+

Mittelmeerraum

 

 

 

5.4. Alternative Spleißstellen (Exon)

 


 

Codon 19 (A=>G) Hb Malay

+

Malaysier

 

Codon 24 (T=>A)

+

Japaner

 

Codon 26 (G=>A) Hb E

+

Südost Asiaten

 

Codon 27 (G=>T) Hb Knossos

+

 

 

 

 

6. Mutationen mit funkionell inaktiver mRNA
6.1 Nonsense Mutationen

 


 

Codon 15 (TGG=>TAG)

0

Inder

 

Codon 15 (TGG=>TGA)

0

Portugiesen

 

Codon 17 (A=>T)

0

Chinesen

 

Codon 22 (G=>T)

0

Isländer (Reunion)

 

Codon 26 (G=>T)

0

Thailänder

 

Codon 35 (C=>A)

0

Thailänder

 

Codon 37 (G=>A)

0

Saudi-Araber

 

Codon 39 (C=>T)

0

Mittelmeerraum, Europäer

 

Codon 43 (G=>T)

0

Chinesen

 

Codon 61 (A=>T)

0

Afroamerikaner

 

Codon 90 (G=>T)

0

Japaner

 

Codon 112 (T=>A)

0

Tschechoslowaken

 

Codon 121 (G=>T)

 

Polen, Schweizer, Briten, Japaner

 

Codon 127 (C=>T)

 

Engländer

 

 

 

6.2. Frameshift Mutationen

 


 

Codon 1 (-6)

0

Mittelmeerraum

 

Codons 2/3/4 (-9 bp, +31 bp)

0

Algerier

 

Codon 5 (-CT)

0

Mittelmeerraum

 

Codon 6 (-A)

0

Mittelmeerraum, Afroamerikaner

 

Codon 8 (-AA)

0

Türken

 

Codons 8/9 (+G)

0

Inder, Mittelmeerraum

 

Codons 9/10 (+T)

0

Griechen

 

Codon 11 (-T)

0

Mexikaner

 

Codon 14/15 (+G)

0

Chinesen

 

Codon 15 (-T)

0

Malaysier

 

Codon 16 (-C)

0

Inder

 

Codons 20/21 (+G)

0

Ashkenazi-Juden

 

Codons 22/23/24 (-AAGTTGG)

0

Türken

 

Codon 24 (-G, +CAC)

0

Ägypter

 

Codons 25/26 (+T)

0

Tunesier

 

Codon 26 (+T)

0

Japaner

 

Codons 27/28 (+C)

0

Chinesen

 

Codon 28 (-C)

0

Ägypter

 

Codons 28/29 (-G)

0

Japaner, Ägypter

 

Codon 31 (-C)

0

Chinesen

 

Codon 35 (-C)

0

Malaysier

 

Codons 36/37 (-T)

0

Kurden (Iraner)

 

Codons 37-39 (-GACCCAG)

0

Türken

 

Codons 38/39 (-C)

0

Tschechoslowaken

 

Codons 38/39 (-CC)

0

Belgier

 

Codon 40 (-G)

0

Japaner

 

Codons 40/41 (+T)

0

Chinesen

 

Codon 41 (-C)

0

Thailänder

 

Codons 41/42 (-TTCT)

0

Inder, Chinesen

 

Codons 42/43 (+G)

0

Japaner

 

Codons 42/43 (+T)

0

Japaner

 

Codon 44 (-C)

0

Kurden

 

Codon 45 (-T)

0

Pakistaner

 

Codon 47 (+A)

0

 

 

Codons 47/48 (+ATCT)

0

 

 

Codon 51 (-C)

0

Ungarn

 

Codons 53/54 (+G)

0

Japaner

 

Codon 54 (-T)

0

Algerier, Schweden

 

Codon 54/55 (+A)

0

Inder

 

Codons 56 bis 60
(14 bp Duplikation)

0

Keine Information

 

Codons 57/58 (+C)

0

 

 

Codon 59 (-A)

0

Italiener

 

Codon 64 (-G)

0

Schweizer

 

Codon 67 (-TG)

0

Philippinen

 

Codon 71 (+T)

0

Chinesen

 

Codons 71/72 (+A)

0

Chinesen

 

Codons 72/73 (-AGTGA, +T)

0

Engländer

 

Codons 74/75 (-C)

0

Türken

 

Codon 76 (-C)

0

Italiener

 

Codons 82/83 (-G)

0

Aserbaidschaner, Tschechoslowaken

 

Codons 84/85 (+C)

0

Japaner

 

Codons 84/85/86 (+T)

0

Japaner

 

Codon 88 (+T)

0

Inder

 

Codons 89/90 (-GT)

0

Koreaner

 

Codon 94 (+TG)
β Agnana

 

Italiener

 

Codon 95 (+A)

0

Thailänder

 

Codon 100 (-CTT, +11 bp)

 

Südafrikaner

 

Codons 106/107 (+G)

0

Afroamerikaner

 

Codon 109 (-G)
β Manhattan

 

 

 

Codon 114 (-CT, +G)
β Geneva

 

Franzosen

 

Codons 120/121 (+A)

 

Philippinen

 

Codon 123 (-A)
β Makabe

 

Japaner

 

Codon 123-125 (-ACCCCACC)
β Khon Kaen

 

Thailänder

 

Codon 124 (-A)

 

Russen

 

Codon125 (-A)

 

Japaner

 

Codon 126 (-T)
β Vercelli

 

Italiener

 

Codons 126 bis 136 (-17 bp)
β Westdale

0

Pakistaner, Inder

 

Codons 128/129 (-4,+5) und
Codons 132 bis 135 (-11 bp)

 

Iren

 

Codons 131-132 (-GA)

 

Schweizer

 

 

 

7. Sonstige Mutationen
7.1. 5' Untranslated Sequence

 


 

+10 (-T)

+

Griechen

 

+22 (G=>A)

+

Italiener

 

+33 (C=>G)

+

 

 

+43 (-AAAC)

+

Chinesen

 

 

 

7.2 3' Untranslated Sequence

 


 

Cap site + 1480 (C=>G)

+

Griechen

 

Cap site + 1565 bis 1577
(13 bp Deletion)

 

Türken

 

 

 

IVS-2

 


 

 

+

Tschechoslowaken

 

 

 

8. Strukturvarianten mit β Thalassemia Phänotyp
Missense Mutations

 


 

Codon 28 (Leu=>Arg)
β Chesterfield

 

Engländer

 

Codon 32 (Leu=>Glu)
+ Codon 98 (Met=>Val)
β Medicine Lake

 

 

 

Codon 60 (Val=>Glu)
β Cagliari

 

Italiener

 

Codon 106 (Leu=>Arg)
β Terre Haute
(früher β Indianapolis)

 

Nordeuropäer, Franzosen

 

Codon 110 (Leu=>Pro)
β Showa-Yakushiji

 

Japaner

 

Codon 114 (Leu=>Pro)
β Durham NC/β Brescia

 

Russen, Iren, Italiener

 

Codon 115 (Ala=>Asp)
β Hradec Kralove

 

Tschechen

 

Codon 126 (Val=>Gly)
β Neapolis/β Dhonburi

+

Italiener, Thailänder, Deutsche

 

Codon 127 (Gln=>Pro)
β Houston

 

Briten

 

Codon 127 (Gln=>Arg)
β Dieppe

 

Franzosen

 

 

 

9. Deletion oder Insertion von Triplett Codons

 


 

Codons 24/25 (-GGT)

 

Keine Information

 

Codons 30/31 (+CGG)

 

Spanier

 

Codons 33/34 (-GTG)
β Korea

 

Koreaner

 

Codons 33-35 (-6 bp)
β Dresden

 

Deutscher

 

Codons 108 bis 112 (-12 bp)

0

Schweden

 

Codons 124 bis 126 (+CCA)

 

Armenier

 

Codons 127 bis 128 (-AGG)
β Gunma

 

Japaner

 

Codons 134 bis 137 (-12 bp, +6 bp)

 

 


 

 

 

β-Thalassämie auslösende Deletionen β-Globingen und Locus Kontrollregion

 

*